Они процветают на нашей коже, устилают наши слизистые оболочки и всю жизнь живут в желудке, в глазах, в носу. Невозможно сделать их точный подсчет, но, похоже, бактерий в десять раз больше, чем клеток в нашем теле, иными словами - сотни тысяч миллиардов, состоящих из 5000 видов!

      Это сожительство обязательно влияет на организм, а потому возникла международная программа изучения генов этих «обитателей человека». На ближайшие 10 лет понадобится 100 миллионов евро для получения характеристик метагенома.

       Задача амбициознее декодирования генома человека, поскольку эти бактерии имеют в 100 раз больше генов, чем клетки. Но работа обязательна. Мы слишком увлеклись геномом. И не станет сюрпризом, что многие его характеристики определяются нашими невидимыми компаньонами. Восприимчивость к лекарствам, к примеру, или предрасположенность к некоторым видам рака. Возможно, к ожирению имеют отношение те же бактерии из желудочной флоры.

       С изобретением микроскопа выяснилась степень нашей колонизации, особенно желудочного тракта. Для этого надо лишь подсчитать количество бактерий в грамме экскрементов. Но дальше идти невозможно: четыре пятых видов вне организма не размножаются. Мы пока не в силах изолировать эти бактерии. И только доступ к их геному обеспечит дальнейший прогресс.

      Если бактерии больше известны по тем болезням, которые они вызывают, то большинство из них сумели создать добрососедские связи со своими сородичами и тканями, в которых обитают. К примеру, Streptococcus pneumoniae. Треть их носителей пневмонией никогда не заболевают. То же самое с возбудителями ботулизма, столбняка или дифтерии. Как и всех комменсальных гостей (питающихся с того же стола) нашего кишечника. Для создания проблемы эти бактерии должны выбраться из своей экологической ниши.

       Механизм, превращающий безобидную бактерию в патогенную, остается неизвестным. Но исходный сценарий не меняется: событие, вызывающее развитие штамма, до сих пор второстепенно. Оказавшись в трудном положении, бактерия показывает жажду к завоеванию и атакует своих соседей и своего хозяина.

         Бактерию можно носить в себе, ни разу не испытав никаких проблем, но в больничном контексте, к примеру, изменения флоры могут сделать ее доминантной. Так произошло со штаммом Clostridium в больницах Нор-Па-де-Кале. Но в большинстве случаев комменсальные бактерии ими и остаются. Они живут в прекрасном симбиозе с хозяином и могут жить долго, словно единый организм в нашем теле. Пора привыкнуть, что мы существуем не в одиночестве. Каждый извлекает свою выгоду. Мы их приютили и создали им среду, в которой можно жить. В обмен они уничтожают поглощаемую нами целлюлозу и производят необходимые вещества, вроде витамина К.